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蛋白质组学是当前快速发展的一门技术科学,并且在生命科学研究中发挥着越来越重要的作用。但小编了解到,目前还是有不少人只是惊叹于它的高大上,却不知道它到底是何方神圣。因此,北京蛋白质组学研究机构在这里简单先介绍下蛋白质组学。
何为蛋白质组学?
蛋白质组学的概念先由MarcWilkins于1994年提出,是以一种基因组所表达的全套蛋白质为研究对象,即通过大规模、高通量、系统性地研究细胞、组织或生物体的蛋白质特征(包括蛋白质的表达水平,翻译后修饰种类与位点,蛋白-蛋白相互作用等等),从而进一步研究蛋白质对于机体的疾病发生发展、细胞代谢等细胞生命活动进程的动态影响,解释基因表达调控的机制。
为什么需要蛋白质组学?
蛋白质组学的出现是生命科学研究发展至今的一个必然趋势。蛋白质作为生命性状的体现者和生命活动的承担者,是随着组织、甚至环境状态的不同而改变,这是明显不同于基因的地方。而传统的对单个蛋白质进行研究的方式已无法满足后基因组时代的需求,因为生命现象的发生往往是多方面的影响,在执行生命功能时,蛋白的表现是多样的、动态的、交织成网络通路的。因此要对生命的复杂活动有多方面而深入的认识,就需要在整体的动态水平上对蛋白质网络通路进行研究。
如何研究蛋白质组学?
相对于基因组而言,由于蛋白质组的结构复杂、不同蛋白的数量差别大以及样品处理较为复杂等原因,使得蛋白质组的发展滞后于基因组学研究。随着质谱技术的进步,质谱的灵敏度,分辨率以及扫描速度等都得到了很大的提升,这很大地推动了蛋白质组学的发展。
基于质谱的蛋白质组学研究的实验流程,主要包括样品的前处理、质谱检测和数据分析等。在样品分析前处理的过程中,为了提高质谱鉴定的深度和覆盖率,一般可采用液相色谱(HPLC)或者离子交换色谱(Ionexchange)对肽段进行分级。质谱检测中常用到的离子化方法有电喷雾离子化(ESI)和基质辅助激光解吸离子化(MALDI),目前市场上常用的质谱分析器主要包括四级杆(Quadrupole)、离子阱(Ion trap)、轨道阱(Orbitrap)以及飞行时间(Time offlight)和傅里叶变换离子回旋共振(FTICR)。在后期的数据分析过程中,需要用到Mascot、Sequest或者MaxQuant等搜库引擎或搜库软件。
蛋白质组学可以做什么?
新的高分辨率生物质谱技术凭借其深度和全局性对大量生物样本的整体蛋白质表达谱、修饰谱等进行定性和定量分析,使得人类基因组终产物的全景图——人类蛋白质组草图也于2014年被构建和报道,这是蛋白质组学研究领域的一个里程碑。
蛋白质组学现已被广泛应用于生命科学研究领域,对理解细胞生长、分化、代谢、衰老与癌变有着重要作用。尤其在疾病的研究中,蛋白质组学可以通过系统性地研究蛋白质表达和翻译后修饰变化对疾病的影响,从而在分子层面对疾病进行分型,以起到对个性化准确治疗研究的推进作用。蛋白质组学在准确医学方面的应用是当今迅猛发展的研究领域之一,随着蛋白质组学技术的不断进步和广泛应用,基于蛋白质组学技术的准确医疗有望在不久的将来应用于大规模的临床实践中。因此,蛋白质组学将拥有更加广阔的前景。
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