蛋白质组学

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蛋白质组学,糖基化蛋白质组学,多组学联合分析
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「青莲百奥」需要鉴定蛋白的宝宝集合啦

2019-07-19 00:00:00

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蛋白质组学

不得不感慨科技发展的迅猛,学科串联下,我们能通过越来越便捷的方法去实现我们的想法,各种与数字信息化结合的升级版仪器,各类生物信息分析软件都让人眼花缭乱,蛋白组学虽说发展史不久,可鉴定蛋白的技术已是非常成熟,特别是液质联用技术的出现,为我们的蛋白组学带来更多的可行性和可实现性。宝宝们,走过路过不要错过,青莲百奥给您送去“规范,精细,高效”优质服务,各种福利大放送,性价比绝得扛得住比较,值得各位小伙伴儿们种草哈(*^▽^*)~蛋白质组学

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【产品简介】
青莲百奥可零压力实现对蛋白质全谱(shotgun)和蛋白质胶点/胶条/溶液混合物(SDS-PAGE,IP产物,Pull down产物)的鉴定,单蛋白或丰度较高样本(体外泛素化、体外磷酸化、IP富集产物)乙酰化、磷酸化、琥珀酰化、泛素化、甲基化、糖基化等多种翻译后修饰位点鉴定。采用HPLC-MS/MS高效液相色谱-质谱联用技术,液相色谱作为分离技术,质谱作为检测系统,完成对样本的定性分析。液质联用的优势即液相对复杂样品的高分离能力与质谱的高选择性、高灵敏性相结合,目前,在药物分析、食品分析和环境分析等许多领域的到了广泛的应用。

【技术平台】

青莲百奥质谱平台



Q ExactiveTM组合型四级杆Orbitrap;


Q ExactiveTMHF组合型四级杆Orbitrap;


Orbitrap FusionTMTribridTM;


Orbitrap FusionTMLumosTMTribridTM三合一,任君挑选。


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蛋白质组学

【技术原理】
HPLC-MS/MS高效液相色谱-质谱联用技术
(1)蛋白样品酶解成肽段;
(2)肽段在HPLC中分离;
(3)分离的肽段进入质谱进行离子碎片化;
(4)经过质谱质量分析器检测器得到谱图;
(5)谱图信息经过生物信息统计分析,得到谱图的注释信息;
(6)生成样品鉴定报告。
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【送样标准】
样品为胶点、胶条或泳道时,要求条带清晰,无降解。
蛋白溶液进行SDS-PAGE电泳,两种电泳方式任选其一:
(1)蛋白洗脱液,跑分离胶5cm(不含浓缩胶的SDS-PAGE),切下5cm胶条,放入1.5ml离心管中。
(2)蛋白洗脱液,跑SDS-PAGE标准的胶,切下目标条带即可,放入1.5ml离心管中。
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【数据展示】
1. 色谱图(BPC base peak chromotography)
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2. 数据库
数据库的选择是以所测物种、数据库注释完备性及序列可靠性为参考依据的。在选择数据库时,遵循如下原则:若公共蛋白数据库比较全面,直接选用该物种蛋白质组数据库;若公共蛋白质组数据库很小,则可以选择与被测样品最为相关的大类蛋白质组数据库,也可以用此物种的转录组或者基因组翻译的蛋白质数据库。
搜库参数一并附于鉴定报告中。

3. 原始质谱数据
产生的质谱原始文件Maxquant进行搜库及定量分析。

4. 鉴定结果统计
mmexport1607315088655.jpg表注:鉴定基本信息统计。
第1列为样品编号;
第二列为谱图总数;
第三列是鉴定谱图数,即与肽段匹配的离子得分大于鉴定阈值的谱图的个数;
第四列是鉴定肽段数,即与鉴定谱图所对应的肽段去重复之后的个数;
第五列是鉴定蛋白数,即与鉴定肽段所对应的蛋白个数,这些蛋白拥有至少一个独有的鉴定肽段;

5.蛋白质的注释,如果有要求也是可以满足的~~

【服务周期】
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需要做蛋白鉴定的宝宝,抓紧时间联系我们吧,扫描二维码关注我们,点击公众号,查阅更多优惠,有干货也有福利哦!

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