采用有机溶剂共沉淀和酸辅助再溶解方式提取生物多肽。使用tims TOF HT 4D-DDA 质谱检测技术进行高通量的蛋白质组学检测。质谱原始文件进行de novo和基于数据库的搜库分析，并对数据进行质量控制、肽段理化性质统计、差异肽段筛选和功能富集分析等。
筛选疾病相关的特征肽段，开发疾病早筛早诊的标志物
筛选疾病关键肽段导致疾病发生发展的机制研究
筛选入药动植物的活性肽段
通过食品中特殊肽评价食品加工工艺和食品安全
青莲百奥特色分析内容：
预测肽段活性：一来可以验证搜库的准确性，二来可以将之与相关前体蛋白生物活性的结构域相匹配，从而预测其在前体蛋白中的定位和功能。
基于功能肽库对肽段注释：功能肽是在体内担负着重要调节功能的肽类物质，与生命体的生长、代谢、免疫、信号传导等生理活动息息相关。通过功能肽库注释帮助发现样本中的功能肽段。
蛋白质从头测序技术（De Novo Sequencing）是利用串联质谱（MS/MS）获取离子，根据两个片段离子之间的质量差来计算肽链上氨基酸残基的质量，从而得到蛋白的氨基酸序列的分析过程。De novo分析的优势在于不需要依赖任何数据库，就可对已知蛋白或未知蛋白进行序列分析。
参考多篇文献总结并测试出最优多肽提取方案。
提取效率高，鉴定深度高，助力新肽的发现
共计完成项目100+
完成物种类型30+
合作单位40+
发表期刊：Theranostics
影响因子：12.4
发表单位：浙江大学
发表时间：2023.05.21
| 样本类型 | 样本来源 | 送样量 |
| 动物组织 | 常规组织（脑、心、肝、肺、肾、肌肉等柔软组织） | 50mg |
| 坚硬组织（软骨、毛发） | ||
| 植物组织 | 柔软组织（木本植物的也、花等，草本植物，藻类，蕨类植物） | 500mg |
| 坚硬组织（根、树皮、树枝，果实种子等） | / | |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体（菌体沉淀） | 200μL |
| 细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞（细胞计数/沉淀） | 107 |
| 液体类 | 血浆/血清/脑脊液 | 100μL |
1）疾病机制研究
2）疾病诊疗标志物
3）功能肽鉴定：药物成分肽/抗菌肽/风味肽
4）食品加工工艺
5）食品品质和安全评价
6）食品营养消化
7）动植物多肽功能机制
1）多肽提取：有机溶剂结合酸提取
2）质谱鉴定：基于3D或4D质谱平台，采用数据依赖采集模式（DDA）进行质谱检测
3）数据库比对：搜库方法分为De novo和Database 2种，①De novo：使用串联质谱法根据肽段的断裂特征进行直接分析，能够对蛋白质数据库中未包含的肽序列、新物种的蛋白质序列和基因组尚未测序的蛋白质序列进行分析；②Database：基于蛋白质数据库搜索样本肽序列
4）数据分析：基于数据库搜库结果进行数据分析，分析内容包括：①基础分析：肽段理化性质（内源多肽的剪切规律、肽段的折叠程度和稳定性）、数据预处理（数据归一化、缺失值过滤和填补）、定性和定量结果统计（肽段数目、丰度分布范围、聚类分析、PCA分析、PLS-DA分析、变异系数分析）②差异肽段分析：差异肽段筛选（差异肽段统计、火山图、聚类热图、小提琴图、ROC分析）、功能分析（GO功能分析、KEGG通路分析、GO slim分析、Pfam分析、互作网络分析）③多肽特色分析：肽段活性预测、功能肽注释
