蛋白质组学

北京青莲百奥生物科技有限公司

多组学推动的精准医学

服务咨询热线

010-53395839

蛋白质组学,糖基化蛋白质组学,多组学联合分析
您当前的位置 : 首 页 > 产品中心 > 多组学联合分析
代谢组与蛋白组联合分析

代谢组与蛋白组联合分析

  • 所属分类:多组学联合分析
  • 浏览次数:
  • 发布日期:2022-04-12 14:51:29
  • 产品概述
  • 案例解析

多层组学整合分析是指对来自基因组、转录组、蛋白组、代谢组和脂质组等不同生物分子层次的批量数据进行归一化处理、比较分析和相关性分析等统计学分析,建立不同层次分子间数据关系。同时结合 GO 功能分析、代谢通路富集、分子互作等生物功能分析,系统多方面地解析生物分子功能和调控机制。不同分子层次的组学数据进行整合分析一方面可以相互验证,另一方面也有助于相互补充,实现对生物变化大趋势与方向的综合了解, 提出分子生物学变化机制模型,并筛选出重点代谢通路或者蛋白、基因、代谢、脂质产物进行后续深入实验分析与应用。


联合分析研究思路


技术优势

  1. 通过对不同层面的表达水平分析,实现对蛋白质及代谢物的全谱分析。

  2. 同时实现从“因”和“果”两个方向探究生物学问题,相互间的验证作用更明显。

  3. 阐述分子调控 - 表型间的关联机制,系统全面地解析生物分子功能和调控机制。

  4. 从海量的数据中去伪存真,筛选出重点代谢通路或者蛋白、代谢产物进行后续深入实验分析与应用。


联合分析图例展示

多组学联合分析案例解析


研究背景

丙型肝炎病毒(HCV)感染是肝脏疾病的主要原因,包括脂肪变性、纤维化和肝癌。然而,促进肝脏疾病进展的机制尚不清楚。


样本类型

HCV 感染患者肝组织;类肝细胞模型;模型小鼠肝组织


技术策略

代谢组学 + 蛋白组学 + 转录组


研究思路


结果速递

从 HCV 感染的蛋白基因组图谱中可以明显观察到,HCV 感染的过氧化物酶体功能严重受损。过氧化物酶体参与脂质合成、信号传导、链脂肪酸的 β 氧化。HCV 病毒感染破坏与过氧化物酶体功能和脂质稳态相关的代谢途径,造成细胞器的代谢功能受损,并在感染细胞中积累脂肪酸。HCV 感染增加了肝细胞内链长为 20-26 个碳的脂肪酸的胞内浓度,葡萄糖消耗的增加、乳酸盐的积累和苹果酸盐的减少,证明糖异生作用受损。测量肝细胞内乳酸通量时,观察到显著的细胞内积累。这些数据表明,持续的 HCV 感染增强了细胞内长链脂肪酸和葡萄糖的代谢,并造成乳酸通量的 warburg 样转移(癌细胞也会将葡萄糖代谢为乳酸盐),这是癌症或细胞发生癌变的标志。


过氧化物酶体增殖激活受体 α(PPAR-α)是 HCV 敏感的调节因子。作者观察到 HCV 感染强烈抑制了肝细胞中 PPAR-α 的表达。数据分析也发现,感染会诱发 STAT3 转录信号,而 STAT3 的激活会导致 IL-6R 受体转录的快速抑制。此外实验证明,抑制 STAT3 活性可减少病毒对过氧化物酶体基因的抑制,表明 STAT3 信号通路与过氧化物酶体之间存在调控联系。


参考文献

Lupberger J, Croonenborghs T, Roca Suarez AA, et al. Combined Analysis of Metabolomes, Proteomes, and Transcriptomes of Hepatitis C Virus-Infected Cells and Liver to Identify Pathways Associated With Disease Development[J]. Gastroenterology, 2019, 157: 537-551.


上一篇:16S rDNA与代谢组关联分析2022-04-12
下一篇:蛋白组与转录组联合分析2022-04-12

最近浏览:

北京青莲百奥生物科技有限公司

固话:010-53395839
邮箱:service@qinglianbio.com
地址:北京市海淀区永丰产业基地绿海大厦C座301


扫一扫,关注我们