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宏基因组测序

宏基因组测序

  • 所属分类:NGS技术服务
  • 浏览次数:
  • 发布日期:2022-04-12 14:33:22
  • 产品概述
  • 案例解析

宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组)是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,即环境中全部微生物遗传物质的总和。
宏基因组学(Metagenomics),一般指通过直接从特定生态环境样品中提取全部微生物的DNA,进行较高通量测序分析,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能、代谢网络及与其所在的生态环境间的互作情况等的一门学问。


技术路线

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测序策略

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样本要求

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生信分析

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部分数据展示

数据质量评估:

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菌群分布结果:

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物种丰度热图:

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KEGG分类结果:

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服务周期

样本质控合格后30个工作日


参考文献

[1]Petersen Lauren M,Bautista Eddy J,Nguyen Hoan,Hanson Blake M,Chen Lei,Lek Sai H,Sodergren Erica,Weinstock George M. Community characteristics of the gut microbiomes of competitive cyclists.[J]. Microbiome,2017,5(1).

[2]Xiong Xuejian,Bales Elise S,Ir Diana,Robertson Charles E,McManaman James L,Frank Daniel N,Parkinson John. Perilipin-2 modulates dietary fat-induced microbial global gene expression profiles in the mouse intestine.[J]. Microbiome,2017,5(1).

[3]Cookson William O C M,Cox Michael J,Moffatt Miriam F. New opportunities for managing acute and chronic lung infections.[J]. Nature reviews. Microbiology,2018,16(2).

[4]Gu W, Miller S, & Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease,2018.

[5]Hu Hui-Li,Guo Ling-Yun,Wu Hong-Long,Feng Wen-Ya,Chen Tian-Ming,Liu Gang. Evaluation of next-generation sequencing for the pathogenic diagnosis of children brain abscesses.[J]. The Journal of infection,2019.


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