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血浆蛋白质组在肿瘤领域中的研究进展与思路,你该知道的,都在这里了...

2023-09-05 00:00:00

肿瘤(Tumor)是机体在各种致癌因素作用下,局部组织的某一个细胞在基因水平上失去对其生长的正常调控,导致其克隆性异常增生而形成的新生物。一般将肿瘤分为良性和恶性两大类。良性肿瘤一般称为“瘤”,恶性肿瘤来自上皮组织者称为“癌”。利用蛋白质组学的力量进行的癌症生物学研究可以在多个层面有效地用于研究癌症和改善癌症的治疗。


迄今为止,蛋白质组学已经成为生物学研究的基本组成部分,并被认为是发现新的生物标志物和个性化治疗的关键方法。血浆被认为是蛋白质组学分析的合适基质。血液有一个复杂的蛋白质组,反映了许多组织蛋白质组亚群。血浆的动态特性反映了患者的不同身体状态,从而有可能在空间和时间上监测疾病进展,从而更全面地了解肿瘤发生中的分子事件。


今天,小编为大家总结了近年来血浆蛋白组在肿瘤研究领域的研究策略。更多精彩,继续在本周四(9月7号)下午在青莲直播间为大家呈现,欢迎各位老师前来讨论。


肿瘤血浆蛋白质组研究进展


血浆蛋白组学是寻找早期诊断生物标志物的更全面、更稳定的亚蛋白质组学,具有更高的临床转化价值,与临床化学参数具有很强的相关性。2010年悉尼人类蛋白质组组织会议上提出人类血浆蛋白质组计划启动后,对于肿瘤的血浆蛋白质组检测的研究层出不穷。针对于肺癌,肝癌,乳腺癌,结肠癌等疾病的诊断标志物,诊断/预后模型和分子机制的研究成果陆续发表。

图1:血浆蛋白质组学在肿瘤领域文献统计(pubmed)

图2:血浆蛋白质组学在肿瘤研究中应用的高分文章(部分)



肿瘤血浆蛋白质组研究思路


阿根廷生物与医学实验研究所于2023年在《Clinical Cancer Research》上发表的关于米非司酮的乳腺癌治疗效果的研究中,对20例管腔型乳腺癌患者的蛋白质组和转录组进行检测,筛选乳腺癌驱动基因和蛋白。对比米非司酮治疗前后患者的蛋白质组和基因组,指出米非司酮在该队列患者中具有抗增殖作用,并揭示了解释其治疗作用的关键生物过程。

图3:多组学表征米非司酮的乳腺癌治疗效果[1]


福建医科大学附属医院于2023年在《Journal of the American Academy of Dermatology》发表关于Stevens-Johnson 综合征 (SJS) 和中毒性表皮坏死松解症 (TEN)的预后标志物筛选研究中,对83例SJS/TEN患者分别接受甲泼尼龙单药治疗和阿达木单抗联合治疗。阿达木单抗联合糖皮质激素治疗能够有效改善SJS/TEN患者的临床表型。通过检测患者的血浆蛋白质组,筛选出APOA4作为SJS/TEN的预后标志物。

图4:血浆蛋白质组学分析发现SJS/TEN预后标志物[2]


上海交通大学医学院于2023年在《Biomarker Research》发表该实验室构建的非小细胞肺癌的诊断模型的研究。对于110名接受治疗的NSCLC患者、108名良性肺部疾病(BPD)患者和100名健康对照(HC),采用TMT-LC-MS/MS技术检测中不同人群中的蛋白质组。使用逻辑回归算法构建高性能非小细胞肺癌筛选模型并通过测试集验证了模型的准确性。

图5:血浆蛋白质组分析构建肺癌诊断模型[3]


通过不同文章的研究思路分析,不难发现血浆蛋白质组在肿瘤领域相关文章常用的研究策略。基于不同样本的血浆蛋白质组和其他组学分析进行模型构建,根据组学差异评价药物疗效,筛选肿瘤的特征标志物,为肿瘤的诊断和检测提供数据指导,为肿瘤发生发展的机制研究提供数据支撑。


图6:肿瘤血浆蛋白质组学研究思路


系列直播课第二期,肿瘤研究领域的血浆蛋白质组学


为了帮助大家将血浆蛋白质组学技术更好的应用于自己的研究中,青莲百奥直播间将在金秋九月为大家带来《“血”无止境—血浆蛋白质组学技术与应用》系列直播课,为大家深度剖析血浆蛋白质组学在肿瘤、心血管、神经、感染四大应用领域的研究进展和研究思路,以及血浆蛋白质组学样本前处理、质谱检测、生物信息挖掘等环节的新方法策略。


《血浆蛋白质组学技术与应用》系列直播课第二期将本周四(9月7日)下午启航,为大家进行血浆蛋白质组学在肿瘤研究中进展、趋势和研究策略的全面、深入解读,涵盖肿瘤诊断,泛癌图谱,肿瘤预后标志物筛选,治疗疗效评价等不同方向。更多研究套路,等你来听~


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