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北京蛋白质组学——青莲百奥引进赛默飞巅峰之作——全能王Orbitrap Eclipse三合一质谱仪

2021-11-11 13:53:46


北京蛋白质组学



赛默飞重磅推出三合一系列的创新之作——Thermo Scientific™ Orbitrap Eclipse™ 质谱仪,旨在解决生物学研究中的分析难题,轻松应对北京蛋白质组学,生物制药与蛋白质结构分析研究中的各项挑战。自2013年推出一代三合一Orbitrap Fusion质谱仪开始,该系列整合了四等级杆、离子阱和Orbitrap质量分析器的多功能性和可用性,具有很高分辨率、灵敏度、稳定的高质量精度,以及多项可延展性等优点。




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PART.1硬件结构及提升

性能比尖通用万间

1、QR5分段式四杆质量过滤器:具有杰出的母离子选择性和灵敏度

2、实时检索:为TMT分析提供的深度和准确度

3、高质量范围MSn:满足非变性蛋白组复合物的结构分析

4、质量转移电荷减少技术:简化谱图数据

5、多种可选功能满足更多需求:IC|ETD|UVPD|1M|HMRn|PTCR|FAIMS Pro interface




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PART.2

全能王火力全开

1、单细胞蛋白组的应用

“Improved Single-Cell Proteome Coverage Using Narrow-Bore Packed NanoLC Columns and Ultrasensitive Mass Spectrometry”一文作者在单细胞蛋白组学技术研究中将先前开发的 nanoPOTS 平台与液相色谱 (LC) 分离的系统进一步小型化,并且结合使用了超灵敏的新一代质谱仪Orbitrap Eclipse Tribrid。在 nanoPOTS 样品制备后,使用 20 μm 内径nanoLC 柱中对单个细胞蛋白质消化物进行分析。使用 Orbitrap Eclipse Tribrid 质谱仪实现了超灵敏 LC-MS 分析,单个 HeLa 细胞平均鉴定出 874 个蛋白质组。这代表无标记单细胞蛋白质组覆盖率相对于先前使用更大内径(30 μm 内径)LC 色谱柱与上一代 Orbitrap Fusion Lumos 质谱仪耦合的工作增加了百分之70以上。




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“Ultrasensitive single-cell proteomics workflow identifies >1000 protein groups per mammalian cell”一文中作者使用纳米液滴样品制备、超低流量纳升液相色谱、FAIMS和新一代 Orbitrap Eclipse Tribrid 质谱仪的组合,大大改进单细胞蛋白质组分析。FAIMS 有效地过滤掉了单电荷离子,以便对多电荷肽进行更有效的 MS 分析,从单个 HeLa 细胞中识别出平均 1056 个蛋白质,是之前报道过的很高水平。



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青莲百奥单细胞组学技术

实验流程



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送样标准



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1让您“异”于常人的单细胞组学是如何解决异质性难题的?

2、 生物药表征

通过middle-down质谱法分析单克隆抗体 (mAb) 是一个不断发展的领域,吸引了许多研究人员和生物制药公司的注意。通常,在MS 分析之前,使用液体分级技术分离 mAb 多肽链。使用FAIMS等气相分馏技术可以替代液基分离并减少分析时间和成本。

“Direct measurement of light and heavy antibody chains using ion mobility and middle-down mass spectrometry”,作者提出了一种快速的 FAIMS 搭配超灵敏的新一代质谱仪Orbitrap Eclipse Tribrid的串联质谱方法,能够以简单和快速的方式表征 mAb 轻链和重链的多肽序列。这种新方法使用不同的解离方法获取碎片数据需要大约 24 分钟,比常规液相色谱-MS/MS 分析快百分之 40-60。



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轻链氨基酸序列覆盖度为百分之57,重链氨基酸序列覆盖度为百分之36,碎片离子质量偏差在3ppm以内,Orbitrap Eclipse™在非变性条件下Top-Down结果刷新了以往的记录。

青莲百奥生物药表征项目目录



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1生物药表征系列一

2生物药表征系列二

3生物药表征系列三

4生物药表征系列四

5生物药表征系列五

6生物药表征系列六

青莲百奥可提供一站式蛋白质组学代谢组学转录组学、多组学联合分析等科研服务。青莲百奥在质谱检测方面项目经验丰富,拥有国际的质谱平台,海归坐镇专业生信分析团队,助您在科研道路上乘风破浪,冲击高水平文章。更多技术服务敬请来电咨询:010-3395839。


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